USB 3.1 specifikācija ir sadalīta divās versijās: USB 3.1 Gen 1 (USB 3.0) un USB 3.1 Gen 2. Tālāk ir norādītas galvenās atšķirības starp tām:
1. Datu pārraides ātrums:
- USB 3.1 Gen 1 pārsūtīšanas ātrums ir 5 Gb/s jeb 500 MB/s.
- USB 3.1 Gen 2 pārsūtīšanas ātrums ir 10 Gb/s jeb 1250 MB/s.
2. Jaudas piegādes iespēja:
- USB 3.1 Gen 1 maksimālā jauda ir 5 V/0,9 A (4,5 W).
- USB 3.1 Gen 2 maksimālā jauda ir 20 V/5 A (100 W).
3. Interfeisa forma:
- USB 3.1 Gen 1 saskarnes forma ir tāda pati kā USB 2.0, parasti tiek parādīta kā kvadrātveida tapa.
- USB 3.1 Gen 2 saskarnes forma ir tāda pati kā USB 3.0, parasti tiek parādīta kā plakana apgrieztā āķa tapa.
4. Saderība:
- USB 3.1 Gen 1 ir pilnībā saderīgs ar USB 2.0 ierīcēm.
- USB 3.1 Gen 2 ir saderīgs gan ar USB 2.0, gan USB 3.0 ierīcēm, taču pārsūtīšanas ātrumu ierobežos lēnākā ierīce.
Īsāk sakot, USB 3.1 Gen 2 nodrošina lielāku datu pārraides ātrumu un lielākas jaudas pārsūtīšanas iespējas nekā USB 3.1 Gen 1. Ja jums ir jāpievieno ātrdarbīgas ārējās atmiņas ierīces, augstas veiktspējas aparatūra vai lieljaudas ierīces, tas būtu vairāk ir lietderīgi izvēlēties USB 3.1 Gen 2 interfeisu. Tomēr, ja jūsu ierīces galvenokārt ir USB 2.{13}} laikmeta izstrādājumi, USB 3.1 Gen 1 var būt praktiskāka izvēle.